清兵在路上安营扎寨，一群武林人士耍诡计冲进军营，正巧韦小宝(陈小春 饰)等人在玩骰子，瞬间就被一群武林人士挟持。为首的美女拿起剑挟持韦小宝，韦小宝一见美女心花怒放，不但不害怕反而很开心，武林人士被他的行为激怒，韦小宝施计反将美女挟持。一时间居然改变，韦小宝提出用骰子决定生死，如果美女赢了自己，就放众人离开，可是一局以后美女却输了，韦小宝拉着她的手帮她摇骰子，最终帮她赢了比赛，按照之前的约定放了众人。韦小宝一行人终于来到清凉寺，正在开心之余听到圣旨上写着他取代皇上出嫁修行。一旁的韦小宝痛澈心脾却又不敢忤逆皇上，只好按照寺庙的规矩剃度。一日韦小宝在寺庙外见到一美女尼姑，三招两式将她制服，美女尼姑身边的师妹见状立即逃走。韦小宝将美女尼姑带到自己的房间，自动向佛祖认错，但是执意要娶美女尼姑为妻。次日，晦明方丈向韦小宝引荐蒙古王子葛尔丹、西藏大喇嘛昌齐大法师、云南平西王麾下的总兵马宝。葛尔丹挑衅韦小宝，却遭到他的反击，昌齐大法师提及寺庙窝藏妇女，葛尔丹身边的女子提及韦小宝掳走自己的师姐，韦小宝让众人搜寺，一旁的马宝大人对于韦小宝曾经帮助平西王之事忘恩负义，自动走出来为韦小宝作证，众人见状只好离开此刻。韦小宝收到皇上的圣旨，派韦小宝主持清凉寺，晦明大师决定派出弟子随行。临行前韦小宝让他们在东南西北四个方向各建立茅屋，然后安排给僧人值守。这时双儿(陈少霞 饰)来报，寺庙来了几千喇嘛，韦小宝拜见行痴大师、行癫大师和玉林大师，将喇嘛上门的消息告知，一旁的橙光大师说出众人的意图，决定带着师傅冲出去。韦小宝装出不在意的样子，放任喇嘛们上山，行痴大师明白韦小宝有安排，韦小宝带着玉林大师等人逃出寺庙。韦小宝让大师们伪装成喇嘛的样子逃出寺庙，途中正好遇到多隆(艾威 饰)等人带着三万精兵赶到，韦小宝告诉多隆清凉寺有一群假喇嘛准备伏击皇上，给他一个立功的好机会。老皇爷赞许韦小宝未暴露自己的身份，以及假喇嘛的意图，韦小宝心知此时遇上精兵纯属巧合，开心自己又能逢凶化吉。韦小宝将众人安置在金阁寺，等待着皇上的到来。皇上一见韦小宝关心老皇爷的安危，屏退左右决定与老皇爷见面。韦小宝走上前向老皇爷请安，屋内的老皇爷知道皇上到来，吩咐韦小宝自己作为清修之人，不宜与外人想见，顿时两人面面相觑。皇上伤心咫尺天涯，不肯放弃机会，意气消沉的坐在台阶上伤心流泪。韦小宝见状让他好好发泄，可是皇上的身份不容他大哭大闹，韦小宝只好取代他在门口嗷嗷大哭，怎料门终于打开，皇上见到了父亲老皇爷。